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首先是先天基因的缺陷，矮脚猫天生容易长胖、腿短，四肢会比较粗壮，短小的骨骼会承受比较大的身躯。同时，矮脚猫的胸腔一般会比平常猫的胸腔更加狭窄，心脏的话会更加脆弱，往往更加容易出现心脏方面的问题。并且，矮脚猫的寿命也会比正常的猫咪要短一些，矮脚猫因为腿短，所以说更容易摔伤。
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猫瘟热的治疗周期一般为7日，如果病程超过6天，有可能经过较长时间的恢复期后康复。但是有些猫咪的身体素质比较低，或者没有得到及时有效的治疗，那么也有可能死亡。猫瘟热是由猫细小病毒感染引起的高热、腹泻、呕吐等等为症状的传染病，临床上又叫猫泛白细胞减少症。
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矮脚猫它本身就是一种先天体型基因缺陷的劣势的品种。由于矮脚猫先天腿短，导致它的胸腔窄小，脊柱压力较大，比较容易激发一些腹腔的内科疾病。其次，由于矮脚基因会抑制骨骼的正常生长，就会导致矮脚猫骨骼和关节发育畸形，甚至会对造血功能产生影响。矮脚基因的猫咪，它们运动能力也会受到影响，不利于它们的生存。
